Cụ thể, Kiểm toán Nhà nước sẽ tiến hành 44 đầu mối thuộc các lĩnh vực như ngân sách nhà nước (28 tỉnh, thành phố trực thuộc TW; 15 bộ, ngành và kiểm toán Báo cáo quyết toán Ngân sách nhà nước năm 2012 tại Bộ Tài chính và Bộ KH&ĐT); 39 dự án đầu tư xây dựng (Dự án tái định canh, định cư thủy điện Sơn La theo địa bàn quản lý do UBND tỉnh Sơn La, Điện Biên, Lai Châu làm chủ đầu tư; dự án xây dựng đường Hồ Chí Minh giai đoạn II: Dự án Pắc Bó - Cao Bằng và dự án Chơn Thành – Đức Hòa; dự án Xây dựng đường cao tốc sân bay Liên Khương – chân đèo Prenn…); 3 chương trình, dự án quốc gia; 16 cuộc kiểm toán chuyên đề; 13 đầu mối thuộc lĩnh vực Quốc phòng và 11 đầu mối thuộc lĩnh vực an ninh, các cơ quan Đảng.

Đặc biệt, năm nay sẽ tiến hành kiểm toán 29 tập đoàn kinh tế, tổng công ty, ngân hàng thương mại, như: Tâp đoàn Hóa chất Việt Nam, Tổng công ty Xăng dầu Việt Nam, Tổng công ty Cảng hàng không miền Bắc, Tổng công ty Xuất nhập khẩu và Xây dựng Vinaconex, Tổng công ty cổ phần Xây lắp Dầu khí Việt Nam PVC, Tổng công ty Lâm nghiệp Việt Nam, Tổng công ty Cà phê Việt Nam, Tổng công ty Cổ phần bảo hiểm PVI, Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam, Ngân hàng chính sách xã hội, Tổng công ty đường sông Việt Nam…

Tổng kết công tác kiểm toán năm 2011, Kiểm toán nhà nước cũng cho biết, tổng số kiến nghị xử lý tài chính của 147/151 cuộc kiểm toán đã có báo các phát hành lớn, trong đó các khoản tăng thu hơn 2.534 tỷ đồng (tăng thu ngân sách Nhà nước hơn 1.966 tỷ đồng), các khoản giảm chi hơn 2.282 tỷ đồng (giảm chi ngân sách Nhà nước 2.089 tỷ đồng). Kiểm toán Nhà nước đã kiến nghị đề nghị Chính phủ chỉ đạo các bộ, ngành, địa phương rà soát để huỷ bỏ hoặc thay thế, sửa đổi, bổ sung 68 văn bản không phù hợp với quy định chung của nhà nước và ban hành một số chính sách, chế độ mới phù hợp với quy định của pháp luật.